Fue fundado en 1867 por José Antonio Castañeda. Su nombre se origina, según cuentan, de un español llamado Alfredo, quien cuando iba y venía de su casa y se le preguntaba: ¿de dónde viene usted Don Alfredo?, contestaba que de casa de Calimete, un bracero de la hacienda de don Antonio Castañeda.
Otra versión señala que se debió a la utilización de una marca para el ganado llamada calimba, y que al marcar las reses y proferirse las voces que esa acción requería: "cala y mete", trajo como consecuencia la modificación de la palabra, dando origen al apelativo de Calimete.
La porción central del municipio se encuentra atravesado, de este a oeste, por la Autopista Nacional. Su porción meridional es baja y pantanosa y se interna en la Ciénaga de Zapata.
En algunos sectores centrales del territorio, se siembra arroz y en su parte norte, predomina el cultivo de la caña de azúcar.