La Repúbica de Cuba es un archipiélago, es decir, un conjunto de islas, que responden a la soberanía nacional, junto con sus aguas adyacentes.
Cuba es la ínsula principal, alrededor de la cual están situados cuatro Grupos Insulares: Los Colorados, a lo largo de la costa noroeste de la provincia de Pinar del Río, el cual reúne a 160 cayos y cayuelos.
La cayería Sabana-Camagüey, también conocida por Jardines del Rey, extendida por los territorios de Matanzas, Villa Clara, Sancti Spíritus, Ciego de Ávila y Camagüey, constituye la mayor de esas agrupaciones, con dos mil 517 islas, cayos y cayuelos.
El Archipiélago Jardines de la Reina, ubicado en las aguas bajas al sur de Ciego de Ávila y Camagüey, posee 661 cayos y cayuelos. Por otro lado, el de Los Canarreos, desarrollado en las aguas al sur de las provincias de Pinar del Río, La Habana y Matanzas, y cuya ínsula principal es la Isla de la Juventud, abarca 672 islas, cayos y cayuelos.
En total, los Grupos Insulares cuentan con cuatro mil 10 islas, cayos y cayuelos. Existen otros grupos de pequeñas islas localizadas en los estuarios de los ríos y bahías, los de la cayería de Moa, en la costa norte de la provincia de Holguín y otros pocos, que no pertenecen a los cuatro conjuntos mencionados anteriormente, con la cual esa cifra se eleva a cuatro mil 195 islas, cayos y cayuelos, según datos aportados por el bojeo a Cuba, realizado por el doctor Antonio Núñez Jiménez, y precisados por la Carta Hidrográfica.
Entre las pequeñas formaciones que rodean a Cuba, sobresalen por su importancia turística o ecológica las siguientes: Cayo Levisa, del Grupo Insular de Los Colorados; Cayo Fragoso, con su faro, perteneciente al Grupo
Sabana-Camagüey, al cual también se integran Cayo Francés, Cayo Santa María, Cayo Guillermo, Cayo Coco, Cayo Romano, y Cayo Sabinal.
Cayo Largo, de gran potencial turístico, localizado en el extremo oriental del Archipiélago de Los Canarreos y los cayos de San Felipe, en su extremo occidental, habitat restringido de una rara especie de roedor nombrada jutiíta de la tierra (Capromys Sanfelipensis), son otras de las pequeñas islas que circundan el territorio nacional.
En algunos islotes del Archipiélago Jardines de la Reina, existen instalaciones para la protección y captura de diferentes especies de tortugas marinas. Al norte de este conjunto insular, en los cayuelos del Golfo de Ana María, al sur de las costas avileñas, fue descrita la octava especie de jutía cubana, la Capromys angelcabrerai, muy parecida a la jutía enana.